Šio filmo scenarijų sudaro vienas sakinys: „Tegul per moters kūną nuo kojų pirštų galų iki galvos vaikšto musė, o po to ji tegul išskrenda pro langą“. Šis sakinys apibūdina kino juostoje besiplėtojantį veiksmą. Tačiau „Musės“ pagrindas – emocinis veiksmas, tai, kas slypi po gulinčios moters abejingumu ir įkyriu vabzdžio noru ištyrinėti kiekvieną nuogo kūno centimetrą. Šis filmas – tai paraboliška feminizmo idėjų vizualizacija, lydima išskirtinio režisierės Yoko Ono sukurto garso takelio.